柯克船长（克里斯·派恩 Chris Pine 饰）和企业号的船员们来到了银河系中未知的一个区域，开始完成他们5年的任务——探索新世界，寻找新物种。却在途中滞留异星，遭遇了当地种族追杀，他们必须找到方法离开这个星球。

　　故事开始于两万年前的欧洲北部，彼时正直冰川时期，科达（科迪·斯密特-麦菲Kodi Smit-McPhee 饰）是部落首领的儿子，在一次集体狩猎行动中，他不幸跌落了悬崖，音信全无。所有人都以为科达已经死了，但不幸中的万幸是，洪水卷走了他，使得他保住了一命，然而，水流将科达送往了离部落非常遥远的漫漫